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基于SSR和SRAP標記的紅花玉蘭品種遺傳關系分析及分子鑒定

摘要:【目的】為了解析紅花玉蘭各品種間的遺傳多樣性和遺傳差異等問題,本研究采用SSR和SRAP分子標記方法對紅花玉蘭不同品種的遺傳多樣性水平和遺傳分化程度進行評估,以建立其分子標記體系。【方法】以35個紅花玉蘭品種為實驗材料,分別進行SSR和SRAP標記擴增,計算出SSR和SRAP分子標記的各遺傳參數(shù)。利用NTSYS-pc2.1軟件計算各品種間的遺傳相似系數(shù)并用非加權(quán)法(UPGMA)進行聚類分析。通過R語言分析篩選出能夠完全區(qū)分紅花玉蘭品種的引物對組合。【結(jié)果】經(jīng)篩選共獲得18對具有多態(tài)性且條帶清晰的SSR引物,分別以35個紅花玉蘭品種基因組DNA為模板,共擴增出DNA條帶128條,每對引物擴增條帶在2~15之間,平均每對引物擴增7.1條,平均帶型數(shù)為10.6,平均有效帶型數(shù)為5.4,平均分辨能力(D)為0.72;不同引物的多態(tài)性位點百分比變化范圍很大,在0.142 9~1.000 0之間,均值為0.730 2;Shannon’s指數(shù)平均為0.304 2,范圍是0.086 4~0.433 7;平均期望雜合度為0.248 8,范圍是0.059 2~0.282 3。利用篩選獲得的11對SRAP引物對35個紅花玉蘭品種進行鑒定,共擴增156條DNA條帶,引物擴增條帶數(shù)在7~18之間,平均每對引物擴增14.2條,平均帶型數(shù)為22.7,平均有效帶型數(shù)為13.2,平均分辨能力(D)為0.93;11對引物的多態(tài)性位點百分比平均數(shù)為0.815 6,變異范圍是0.657 1~1.000 0;平均Shannon’s指數(shù)為0.375 9,變異區(qū)間在0.287 2~0.455 3;平均期望雜合度為0.240 4,范圍在0.180 2~0.311 6之間。【結(jié)論】紅花玉蘭具有較高的遺傳多樣性,經(jīng)篩選和優(yōu)化后的SSR和SRAP引物組合均能將現(xiàn)有紅花玉蘭品種完全區(qū)分開,實現(xiàn)了對紅花玉蘭品種的簡便、快速、準確地鑒定,并為紅花玉蘭的保護和繁育,以及新品種的選育提供了重要的參考。

關鍵詞:
  • 紅花玉蘭  
  • 遺傳多樣性  
  • 品種鑒定  
  • ssr分子標記  
  • srap分子標記  
作者:
張妹; 何正權(quán); 馬江; 桑子陽; 朱仲龍; 張德春; 馬履一; 陳發(fā)菊
單位:
三峽區(qū)域植物遺傳與種質(zhì)創(chuàng)新重點實驗室(三峽大學); 湖北省三峽特色植物繁育工程技術(shù)研究中心; 三峽大學生物技術(shù)研究中心; 湖北宜昌443000; 北京林業(yè)大學省部共建森林培育與保護教育部重點實驗室; 北京100083; 湖北五峰土家族自治縣林業(yè)科學研究所; 湖北五峰443413; 五峰博翎紅花玉蘭科技發(fā)展有限公司; 湖北宜昌443400
刊名:
北京林業(yè)大學學報

注:因版權(quán)方要求,不能公開全文,如需全文,請咨詢雜志社

北京林業(yè)大學學報緊跟學術(shù)前沿,緊貼讀者,國內(nèi)刊號為:11-4740/C。堅持指導性與實用性相結(jié)合的原則,創(chuàng)辦于2002年,雜志在全國同類期刊中發(fā)行數(shù)量名列前茅。

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