摘要:【目的】為了解析紅花玉蘭各品種間的遺傳多樣性和遺傳差異等問題,本研究采用SSR和SRAP分子標記方法對紅花玉蘭不同品種的遺傳多樣性水平和遺傳分化程度進行評估,以建立其分子標記體系。【方法】以35個紅花玉蘭品種為實驗材料,分別進行SSR和SRAP標記擴增,計算出SSR和SRAP分子標記的各遺傳參數(shù)。利用NTSYS-pc2.1軟件計算各品種間的遺傳相似系數(shù)并用非加權(quán)法(UPGMA)進行聚類分析。通過R語言分析篩選出能夠完全區(qū)分紅花玉蘭品種的引物對組合。【結(jié)果】經(jīng)篩選共獲得18對具有多態(tài)性且條帶清晰的SSR引物,分別以35個紅花玉蘭品種基因組DNA為模板,共擴增出DNA條帶128條,每對引物擴增條帶在2~15之間,平均每對引物擴增7.1條,平均帶型數(shù)為10.6,平均有效帶型數(shù)為5.4,平均分辨能力(D)為0.72;不同引物的多態(tài)性位點百分比變化范圍很大,在0.142 9~1.000 0之間,均值為0.730 2;Shannon’s指數(shù)平均為0.304 2,范圍是0.086 4~0.433 7;平均期望雜合度為0.248 8,范圍是0.059 2~0.282 3。利用篩選獲得的11對SRAP引物對35個紅花玉蘭品種進行鑒定,共擴增156條DNA條帶,引物擴增條帶數(shù)在7~18之間,平均每對引物擴增14.2條,平均帶型數(shù)為22.7,平均有效帶型數(shù)為13.2,平均分辨能力(D)為0.93;11對引物的多態(tài)性位點百分比平均數(shù)為0.815 6,變異范圍是0.657 1~1.000 0;平均Shannon’s指數(shù)為0.375 9,變異區(qū)間在0.287 2~0.455 3;平均期望雜合度為0.240 4,范圍在0.180 2~0.311 6之間。【結(jié)論】紅花玉蘭具有較高的遺傳多樣性,經(jīng)篩選和優(yōu)化后的SSR和SRAP引物組合均能將現(xiàn)有紅花玉蘭品種完全區(qū)分開,實現(xiàn)了對紅花玉蘭品種的簡便、快速、準確地鑒定,并為紅花玉蘭的保護和繁育,以及新品種的選育提供了重要的參考。
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