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健康人群不同年齡組腸道菌群特征預測模型的研究

摘要:目的利用16S測序數據建立健康人年齡段預測模型,探索不同年齡組腸道菌群特征。方法基于SRA數據庫中2016年923例16S測序數據篩選特征操作分類單元(operational taxonomic units,OTUs),應用隨機森林算法建立幼兒園學生、小學生、中學生、青年人、中年人、老年人和長壽老人7個年齡段預測模型,分析組間菌群差異特征及功能,計算特征OTUs與組間差異通路的相關性。結果基于278個與年齡變化相關的OTUs建立隨機森林年齡段預測模型,準確率達到72.9%;不同年齡組之間存在249個顯著差異通路,主要是異生素生物降解和代謝、脂質代謝和氨基酸代謝通路;在菌群組成和功能層面聚類分析,學生組和中年人組聚為一類,青年人組、老年人組和長壽老人組聚為一類。結論預測模型以及組間聚類結果均說明學生組和中年人組腸道菌群相似,老年人、長壽老人與青年人之間的菌群特征更相近。

關鍵詞:
  • 腸道菌群  
  • 隨機森林算法  
  • 健康人群  
作者:
趙敏; 吳競; 李叢勇; 趙義名; 薛萬國; 孫剛; 石金龍
單位:
解放軍總醫院醫療大數據中心; 北京100853; 解放軍總醫院第一醫學中心消化內科; 北京100853
刊名:
解放軍醫學院學報

注:因版權方要求,不能公開全文,如需全文,請咨詢雜志社

期刊名稱:解放軍醫學院學報

解放軍醫學院學報緊跟學術前沿,緊貼讀者,國內刊號為:10-1117/R。堅持指導性與實用性相結合的原則,創辦于1980年,雜志在全國同類期刊中發行數量名列前茅。

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