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野生矮牡丹高通量轉錄組測序分析

摘要:為探究野生稷山矮牡丹(Paeonia jishanensis)花青素等抗氧化活性物質生物合成的遺傳基礎,本文采用高通量測序技術Illumina NextSeqTM500對其幼嫩葉片、嫩莖和花芽混合池樣本進行轉錄組測序分析。共獲得39450個unigene,其中3563個unigene中有4106個SSR位點。在Swiss Prot數據庫中注釋到29420個unigene,其中11個與花青素生物合成過程相關,22個與類黃酮生物合成過程相關,15個與異黃酮生物合成過程相關;NR數據庫中注釋高達100%,有12個與類黃酮生物合成相關,7個與花青素生物合成相關;GO數據庫中注釋到24291個unigene,分為生物學過程、細胞組分及分子功能等三大類53個功能組,有21個unigene與黃酮、黃酮醇及異黃酮生物合成有關,4個unigene與花青素合成有關;eggNOG數據庫中注釋到38238個unigene,涉及植物生長發育過程絕大多數生命活動過程;KEGG數據庫注釋到5709個unigene,分別定位到6大類別42個代謝途徑,其中25個unigene與花青素生物合成相關。研究表明,在稷山矮牡丹轉錄組序列中,共鑒定和發掘出多個涉及類黃酮化合物生物合成、花青素生物合成過程的相關基因序列及SSR位點,為下一步開展相關代謝合成途徑研究奠定了基礎。

關鍵詞:
  • 稷山矮牡丹  
  • 轉錄組測序  
  • 基因分析  
  • 功能注釋  
作者:
黃春國; 王炳華; 胡桃花; 韓曉麗; 李文廣; 李萍; 郝興宇
單位:
山西農業大學農學院; 太谷030801; 山西農業大學林學院; 太谷030801; 山西省農業信貸融資擔保有限公司; 太原030001; 山西省朔州市氣象局; 朔州036000
刊名:
激光生物學報

注:因版權方要求,不能公開全文,如需全文,請咨詢雜志社

期刊名稱:激光生物學報

激光生物學報緊跟學術前沿,緊貼讀者,國內刊號為:43-1264/Q。堅持指導性與實用性相結合的原則,創辦于1992年,雜志在全國同類期刊中發行數量名列前茅。

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