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西洋參bHLH轉錄因子家族生物信息學分析

摘要:bHLH是真核生物中一類編碼轉錄調控因子的基因家族,在植物生長發育中具有重要的調控作用。通過對西洋參根、葉、花蕾樣品進行轉錄組測序,篩選其中的bHLH家族基因,利用生物信息學方法對篩選到的基因進行表達模式、蛋白結構、細胞定位及系統進化分析。結果顯示:從西洋參轉錄組中共鑒定得到62個西洋參bHLH家族基因,這些bHLH在根、葉、花蕾中具有4種表達模式。西洋參bHLH亞細胞定位預測主要在細胞核內,所有表達產物均包含HLH結構域。進化分析顯示,西洋參中62個bHLH基因可分為18個亞類,其中第Ⅺ亞族中包含最多的bHLH成員,共包含11個bHLH蛋白;第Ⅲf、Ⅳa、Ⅲ(a+c)、Ⅰb(2)、Orphans、Ⅳb亞族中的成員數量均為1個,其他亞族為2~9個。

關鍵詞:
  • 西洋參  
  • bhlh基因家族  
  • 生物信息學方法  
  • 生物合成途徑  
作者:
閆艷; 王希; 周珂輝; 李紀冬; 韓鵬; 邸鵬
單位:
吉林農業大學中藥材學院; 長春130118; 吉林農業大學; 長春130118
刊名:
吉林農業大學學報

注:因版權方要求,不能公開全文,如需全文,請咨詢雜志社

期刊名稱:吉林農業大學學報

吉林農業大學學報緊跟學術前沿,緊貼讀者,國內刊號為:22-1100/S。堅持指導性與實用性相結合的原則,創辦于1979年,雜志在全國同類期刊中發行數量名列前茅。

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