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棗食芽象甲線粒體基因組全序列測定與系統發育分析

摘要:【目的】從線粒體基因組水平上探討棗食芽象甲Scythropus yasumatsui與近緣種的系統發育關系。【方法】利用Illumina MiSeq測序平臺對棗食芽象甲線粒體基因組進行測序,對基因組序列進行拼裝、注釋和特征分析;利用貝葉斯法和最大似然法構建基于象甲科13個物種的線粒體基因組13個蛋白質編碼基因核苷酸序列的系統發育樹。【結果】結果表明,棗食芽象甲線粒體基因組全長為16472 bp(GenBank登錄號:MF807224),包含13個蛋白質編碼基因、22個tRNA基因、2個rRNA基因和2個非編碼控制區,37個基因的排列順序與祖先昆蟲的線粒體基因排列順序一致。13個蛋白質編碼基因的起始密碼子為ATN,其中除了cob和nad1基因的完全終止密碼子為TAG外,其余11個基因的完全終止密碼子為TA(A)。22個tRNA基因中除了trnS1缺少DHU臂,反密碼子由GCT變為TCT外,其余均能形成典型的三葉草結構。基于13個蛋白質編碼基因序列構建的系統發育樹結果顯示,象甲科8個亞科系統發育關系為:(((隱喙象亞科(Cryptorhynchinae)+(象蟲亞科(Curculioninae)+魔喙象亞科(Molytinae)))+長小蠹亞科(Platypodinae))+(粗喙象亞科(Entiminae)+Cyclominae亞科))+隱頦象亞科(Dryophthorinae)+小蠹亞科(Scolytinae))。【結論】在13種象甲科昆蟲物種中,同屬于粗喙象亞科的棗食芽象甲與南美果樹象甲Naupactus xanthographus在系統發育樹中聚為同一分支,表明基于線粒體基因組全序列的分子系統發育結果與傳統的形態分類結果是一致的。

關鍵詞:
  • 鞘翅目  
  • 象甲科  
  • 棗食芽象甲  
  • 近緣種  
  • 線粒體基因組  
  • 蛋白質編碼基因  
  • 系統發育  
作者:
張鋒; 洪波; 王遠征; 李英梅; 陳志杰
單位:
陜西省生物農業研究所; 西安710043; 陜西省酶工程技術研究中心; 西安710043
刊名:
昆蟲學報

注:因版權方要求,不能公開全文,如需全文,請咨詢雜志社

期刊名稱:昆蟲學報

昆蟲學報緊跟學術前沿,緊貼讀者,國內刊號為:11-1832/Q。堅持指導性與實用性相結合的原則,創辦于1950年,雜志在全國同類期刊中發行數量名列前茅。

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