摘要：利用紫扇貝與海灣扇貝的雜交扇貝作為試驗(yàn)對(duì)象,通過轉(zhuǎn)錄組測(cè)序?qū)ψ虾ｋs交一代扇貝EST(expressed sequence tags)序列進(jìn)行挖掘、驗(yàn)證,分析微衛(wèi)星(simple sequence repeats,SSR)在這些序列中的總體分布特征,開發(fā)紫海雜交一代扇貝EST-SSR引物。結(jié)果顯示,紫海雜交扇貝的基因組中含有大量的微衛(wèi)星DNA,且種類豐富。各種類型出現(xiàn)的頻率相差很大,在1~6核苷酸重復(fù)基元中,1~2核苷酸是主要重復(fù)類型,占總SSR的92.75%。三核苷酸重復(fù)序列占比較少,為SSR總數(shù)的6.00%,四核苷酸重復(fù)序列、五核苷酸重復(fù)序列和六核苷酸重復(fù)序列的比例僅為1.25%。應(yīng)用20個(gè)雜交一代個(gè)體對(duì)20對(duì)微衛(wèi)星引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增篩選,其中13對(duì)引物顯示出多態(tài)性,共檢測(cè)到36個(gè)等位基因,每個(gè)位點(diǎn)的等位基因變化從2個(gè)到4個(gè)不等(平均每個(gè)位點(diǎn)2.77),平均觀測(cè)雜合度( Ho )為0.67,平均期望雜合度為( He )0.53,多態(tài)信息含量( PIC )變化范圍為0.32~0.69,平均多態(tài)信息含量( PIC )為0.44。表明紫海雜交一代扇貝保持了較高的遺傳多樣性。試驗(yàn)獲得的EST-SSR引物,可用于紫海雜交一代扇貝的種質(zhì)資源開發(fā)、定向選育及遺傳結(jié)構(gòu)研究。