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云南省6種鵝膏菌DNA條形碼序列分析

摘要:目的對云南省6種鶴膏菌的核糖體大亞基(nuclear large-subunit ribosomal DNA,nLSU rDNA)及內轉錄間隔區(internal transcribed spacer,1TS)DNA序列進行比對分析,探究其親緣關系以找到合適的鑒定鵝膏菌D N A條形碼序列的方法。方法采用試劑盒離心柱法提取6種鵝膏菌DNA,以ITS4/ITS5作為丨T S序列引物和LR5/LROR作為nLSU序列的引物進行PC R擴增,后送至華大基因科技有限公司進行測序。所返回的序列進行遺傳距離分析及鄰接樹構建。結果球基鵝膏、紅托鵝膏與小豹斑鵝膏3種鵝膏菌親緣關系較近。以丨T S序列分析,三者遺傳距離在0.0202?0.0801之間。以nL SU序列分析,三者遺傳距離在0.0031~0.0303之間。黃毒蠅鵝膏與赭蓋鵝膏菌H 2在IT S序列中與黃毒蠅鵝膏20、21、H 7、D l、D16、D 24親緣關系較近,遺傳距離在0.0462~0.0479。赭蓋鵝膏菌7與黃毒蠅鵝膏D 14兩株菌遺傳距離僅有0.1528。從鄰接樹來看ITS序列存在種內多,聚類分析結果不穩定,明顯不同的2個種聚為一支。而nLSU序列可將各種分離開,結論建議鵝膏菌快速鑒定選用nLSU序列作為主要鑒定序列,IT S序列作為輔助序列。

關鍵詞:
  • 內轉錄間隔區  
  • 核糖體大亞基  
  • 鵝膏菌屬  
  • 系統發育  
  • 物種識別  
作者:
任翔; 楊菁; 鄒顏秋頌; 楊祖順
單位:
云南省疾病預防控制中心; 昆明650022
刊名:
食品安全質量檢測學報

注:因版權方要求,不能公開全文,如需全文,請咨詢雜志社

食品安全質量檢測學報緊跟學術前沿,緊貼讀者,國內刊號為:11-5956/TS。堅持指導性與實用性相結合的原則,創辦于2010年,雜志在全國同類期刊中發行數量名列前茅。

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