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采用GBS-seq技術構建甜瓜高密度遺傳圖譜

摘要:【目的】構建甜瓜高密度遺傳圖譜,為研究甜瓜重要性狀基因定位及功能分析奠定基礎。【方法】以甜瓜材料K7-4(高抗霜霉病)和K7-2(高感霜霉病)為親本,雜交再自交得到F 2分離群體。構建GBS文庫并進行雙末端測序,使用滑動窗口的方法進行基因型分型,SAM TOOLS軟件檢測SNP位點,采用Joinmap 4.0軟件進行排圖,用perl SVG模塊繪制連鎖圖,用win QTL cart 2.5進行QTL檢驗,根據復合區間作圖法,使用R/qtl軟件包進行QTL定位。【結果】構建了總長為4823.55 cM的遺傳圖譜,標記間平均遺傳距離為1.43 cM。在苗期、生長中期和生長后期共檢測到26個與甜瓜霜霉病性狀相關的QTL。【結論】基于GBS-seq技術獲得了甜瓜高密度遺傳圖譜,最終將抗霜霉病基因關聯到CM3.5.1_scaffold00005上的6,831,227~7,830,935 bp,約1Mb的區間范圍內。

關鍵詞:
  • 甜瓜  
  • gbs  
  • 遺傳圖譜  
  • 霜霉病  
  • qtl  
作者:
張學軍; 楊文莉; 張永兵; 張健; 郭麗霞; 楊永; 李寐華; 伊鴻平
單位:
新疆農業科學院哈密瓜研究中心; 烏魯木齊830091; 衢州新農都院士工作站; 浙江衢州324022
刊名:
新疆農業科學

注:因版權方要求,不能公開全文,如需全文,請咨詢雜志社

期刊名稱:新疆農業科學

新疆農業科學緊跟學術前沿,緊貼讀者,國內刊號為:65-1097/S。堅持指導性與實用性相結合的原則,創辦于1958年,雜志在全國同類期刊中發行數量名列前茅。

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