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細粒棘球絳蟲Calpain蛋白的生物信息學分析

摘要:目的采用生物信息學軟件分析細粒棘球絳蟲Calpain蛋白(EgCalpain)的結構與抗原表位,為研制基于Calpain的棘球蚴病疫苗提供依據。方法從NCBI核苷酸和蛋白質數據庫下載EgCalpain的核苷酸和氨基酸序列,采用ProtParam、SignalP、TMHMM、Cell-Ploc等在線分析程序,結合DNAStar、DNAMAN等生物信息學軟件分析、預測EgCalpain蛋白的理化性質、信號肽序列、跨膜結構域、亞細胞定位及抗原表位;采用Clustal omega程序對不同物種來源的Calpain蛋白進行多序列比對,并通過MEGA 6.06程序構建鄰接樹。結果 EgCalpain基因全長7 734 bp,包含15個外顯子和14個內含子;EgCalpain基因編碼蛋白由707個氨基酸組成,是一種穩定蛋白,不含有信號肽序列和跨膜區域,可能定位于細胞質。EgCalpain蛋白含有5個T、B細胞聯合表位,分別為267-299 aa、328-356 aa、486-507 aa、546-567 aa、648-662 aa。EgCalpain蛋白與曼氏血吸蟲Calpain的親緣關系較近,與人、牛、羊Calpain的親緣關系較遠。結論 EgCalpain蛋白含有5個T、B細胞聯合表位且與人、牛、羊Calpain的親緣關系較遠,作為棘球蚴病疫苗進行免疫時,可能具有良好的免疫保護作用。

關鍵詞:
  • 細粒棘球絳蟲  
  • 鈣蛋白酶  
  • 生物信息學  
  • 抗原表位  
作者:
王芬; 陳林; 趙明才; 劉家瑞; 黎昆; 李龍; 胡容
單位:
遂寧市中心醫院檢驗科; 四川遂寧629000; 重慶醫科大學基礎醫學院病原生物學教研室
刊名:
中國病原生物學

注:因版權方要求,不能公開全文,如需全文,請咨詢雜志社

期刊名稱:中國病原生物學

中國病原生物學雜志緊跟學術前沿,緊貼讀者,國內刊號為:11-5457/R。堅持指導性與實用性相結合的原則,創辦于1988年,雜志在全國同類期刊中發行數量名列前茅。

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