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插入序列IS6100介導DNA序列轉移的機制研究

摘要:目的插入序列IS6100與耐藥基因轉移密切相關,本研究旨在初步探究IS6100轉移DNA序列的機制。方法以Genbank庫中已有序列中含兩個及兩個以上拷貝IS6100序列的質粒或者染色體為研究對象,通過生物信息分析的方法分析各IS6100側翼的靶位點重復序列(TSD),推測該元件轉座酶可能的工作機制。結果共檢索到22條序列,含5條染色體、16條質粒以及1條定位未知的轉座子序列。其中有13條序列(59%)來自鞘脂菌屬細菌,余下均來自條件致病菌的染色體或質粒。在鞘脂菌屬細菌TKS中,IS6100拷貝數可多達29個,且IS6100和鞘脂菌屬細菌基因組的GC%均接近60%。共有35條不同的8bpTSD在這些菌株中出現的頻率為2~8次。TSD的GC%含量在13%~100%,有87%(30/35)的TSD序列GC%含量均≥50%。這些TSD可同時出現在同一菌株的染色體或質粒內部、同一菌株的染色體和質粒之間、不同菌株的染色體和質粒間。結論IS6100的產生菌可能為鞘脂菌屬細菌。IS6100的作用靶位點沒有高度選擇性,但仍傾向作用于高GC%含量位點。兩個IS6100可以形成復合轉座子,轉移其間的DNA序列,這些轉座事件可以發生在分子間和分子內。

關鍵詞:
  • dna轉座子  
  • 基因轉移  
  • 水平  
  • is6100  
  • 耐藥機制  
作者:
聶璐; 吳奎海; 陳文靜; 李煒煊
單位:
佛山市第一人民醫院檢驗科; 廣東528000
刊名:
中國醫藥生物技術

注:因版權方要求,不能公開全文,如需全文,請咨詢雜志社

期刊名稱:中國醫藥生物技術

中國醫藥生物技術雜志緊跟學術前沿,緊貼讀者,國內刊號為:11-5512/R。堅持指導性與實用性相結合的原則,創辦于2006年,雜志在全國同類期刊中發行數量名列前茅。

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