摘要：通過傳統培養和宏基因組測序方法分析泗洪地區小龍蝦整體、表面、尾肉等不同部位的菌群多樣性,確定不同部位的特定污染菌組成。結果表明:小龍蝦整體的初始菌數達8.4(lg(CFU/g)),且不同部位的微生物群落有明顯差異;通過宏基因組測序發現,在科水平上,黃桿菌科(Flavobacteriaceaea)是泗洪小龍蝦不同部位的優勢菌科,叢毛單胞菌科(Comamonadaceae)、莫拉氏菌科(Moraxellaceae)和氣單胞菌科(Aeromonadaceae)分別是小龍蝦整體、表面和尾肉的優勢菌科;在屬水平上,金黃桿菌屬(Chryseobacterium)、不動桿菌屬(Acinetobacter)和氣單胞菌屬(Aeromonas)分別是小龍蝦整體、表面和尾肉的優勢菌屬,黃桿菌屬(Flavobacterium)在3個部位中相對豐度均較高。